9月12日下午14:00，航海學院江文書記、李翼副院長（主持）、朱寶杉副書記組織召開疫情防控工作線上會議，會議傳達了當日上午學校疫情防控專題會議精神，同時結合航海學院實際，逐項布置航海學院疫情防控工作。
會議指出，當前國內外疫情防控形勢依然嚴峻復雜，校園疫情防控風險高、難度大，全體師生應克服麻痹思想、松懈情緒，逐項落實落細疫情防控工作；每位教師要結合疫情形勢變化和學校教育教學安排，提前做好線上教學各項準備工作，保證線上教學隨時啟動、線上線下隨時切換，確保停課不停教、停課不停學；輔導員、班主任要強化心理疏導和健康教育，及時協調解決暫未返校學生的學習、工作、生活問題，加強人文關懷，營造校園疫情防控良好氛圍。
會議強調，截至9月11日20時，仙游縣已有2地劃定為高風險地區、5地為中風險地區，目前尚在莆田市內的師生暫緩返校；自8月26日以來（含8月26日）本人或共同居住人員中有莆田市旅居史的師生暫緩返校并實施14天居家健康監測（從離開莆田市次日起算），已返校的學生要及時報告輔導員、班主任，按照要求進行隔離觀察，實施每日健康監測。
會后，航海學院領導帶隊檢查了防疫物資儲備情況，走訪了學生宿舍、教室、實驗實訓室等重點場所。